《苏沈良方》中对医理的阐述主要有三个方面：一是对人们求诊疾病的指导；二是对人们养生益寿的指导；三是摘录他人论述治疗眼、齿的医理。作者虽非医者，但从自身求诊经验、对前人养生理论的分析及对他人医学理论的摘录，从而提出自己的观点，将道理论述得有理有据，值得后人参考、借鉴。

《脉说》以脉为题，却非言如何诊脉。《苏沈良方》中先说诊脉之难：“脉之难，古今之所病也。至虚有盛候，大实有羸状，差之毫厘疑似之间，便有死生祸福之异，此古今所病也。病不可不谒医，而医之明脉者，天下盖一二数。骐骥不时有，天下未尝徒行；和扁不世出，病者终不徒死，亦因其长而护其短耳。士大夫多秘所患而求诊，以验医之能否，使索病于冥漠之中，辨虚实冷热于疑似之间。医不幸而失，终不肯自谓失也，则巧饰遂非以全其名。至于不救，则曰是固难治也。间有谨愿者，虽或因主人之言，亦复参以所见，两存而杂治，以故药不效。此世之通患而莫之悟也。”脉诊作为中医四诊“望、闻、问、切”中的一部分，在诊断疾病上有其优势亦有其局限性，不能仅以脉诊为诊断疾病的唯一方法。如果患者不与医生配合，就等于给医生诊疗疾病增加了难度。苏轼以自身就诊经验为例，意图向大家说明患者与医生配合的重要性。“吾平生求医，盖于平时默验其工拙，至于有疾而求疗，必先尽告以所患，而后求诊，使医了然知患之所在也。然后求之诊，虚实冷热先定于中，则脉之疑似不惑也。故虽中医，治吾病常愈。吾求疾愈而已，岂以困医为事哉！”

在《续养生论》中，作者根据郑子产与翼奉之理论提出：“火烈而水弱。烈生正，弱生邪。火为心，水为肾。故五脏之性，心正而肾邪。”以此推导出“铅汞龙虎之说”。并以此说阐释“内丹”的修炼方法为“汞龙之出于火，流于脑，溢于玄英，必归于根。心火不炎上，必从其妃，是火常在根也。故壬癸之英，得火而日坚，达于四肢，浃于肌肤而日壮。究其极，则金刚之体也，此铅虎之自水出者也，龙虎生而内丹成矣。故曰：顺行则为人，逆行则为道，道则末也，亦可为长生不死之术矣。”文中有内丹是长之生药，修炼好内丹则可长生不死之说，这虽有夸大之嫌，但通过五脏调理达到延年益寿的方法是很有借鉴意义的。文中还有对于脐的论述：“人之在母也，母呼亦呼，母吸亦吸，口鼻皆闭而以脐达，故脐者生之根也。”胎儿在母体中依靠脐带吸收营养，所以脐带是人生之根本。

《苏沈良方》认为治眼、齿的方法不同，引张文潜之言“目忌点洗。目有病，当存之；齿有病，当劳之……”并举例“治目当如治民，治齿当如治军。治民当如曹参之治齐，治军当如商鞅之治秦”加以解析。苏轼自少年时期便常患眼疾，因此十分注重对眼、齿的治疗及保健方法，而《苏沈良方》中对眼、齿的治疗及保健方法亦沿用至今。